Устойчивостью к макролидам отличались серотипы: серогруппа 15 В/С (75 %); серотипы 1 и 9V - по 50 %; серотипы 11А и 14 - 44,4и 41,1 % резистентных изолятов, соответственно (табл.). Спектр резистентности невакцинных штаммов к макролидам: треть штаммов 15А и 16F, 20,8 % серотипа 35В были устойчивы к эритромицину. Все изоляты серогруппы 31 были чувствительны к макролидам. Уровень устойчивости к клиндамицину: 50 % штаммов серотипов 9V и 11А были резистентны к клиндамицину. Остальные вакцинные серотипы характеризовались невысоким уровнем резистентности к клиндамицину (5,8-20 %). В то же время 25 % изолятов невакцинного серотипа 31 были нечувствительны к клиндамицину. Устойчивость к клиндамицину прочих невакцинных изоля- тов составила от 8,3 % (16F) до 12,5 % (35В). Установлен высокий уровень устойчивости к сульфоме- таксозол/триметоприму, что согласуется с данными других исследователей [5, 18]. Так, 75 % изолятов серогруппы 15В/С были нечувствительны к данному АМП. Количество резистентных остальных вакцинных штаммов было следующее: 6А/В - 58,8 %; 7F и 19А по 50 % изолятов; 19F и 11А - 45,7 % и 44,4 %, соответственно. Доля устойчивых к сульфометаксозол/триметоприму невакцинных штаммов была довольно высокой и составила: 35В - 54,1 %; серогруппы 31-50 %; серогруппы 16F - 41,6 %; 15A - 33,3 % культур.
Таким образом, скрининг чувствительности к АМП вакцинных серотипов пневмококков, циркулирующих в популяции организованных детей в Республике Татарстан, показал наличие устойчивости у преобладающего большинства вакцинных серотипов. Довольно высокий уровень устойчивости был характерен и для некоторых невакцинных серотипов: треть штаммов серотипа 15А была устойчива к Р-лактамным АМП, к макролидам и сульфометаксозол/триметоприму.
Выводы
Распространенность пневмококкового носительства у организованных детей в Республике Татарстан составила 22,7-38,0 % в зависимости от возраста. Серотиповой состав циркулирующих в носоглотке детей пневмококков представлен в основном вакцинными серотипами, в то же время регистрировались и невакцинные серотипы. Мониторинг пневмококковых штаммов в Республике Татарстан позволяет отслеживать смену серотипового состава и оценивать эффективность применения пневмококковых вакцин в регионе.
Проведенный скрининг антибиотикочувствительности носоглоточных S. pneumoniae показал, что вакцинные штаммы характеризуются довольно высоким уровнем устойчивости, что, вероятно, обусловлено селективным действием антибиотиков, используемых в качестве базовой терапии инфекций верхних дыхательных путей. Массовая иммунизация пневмококковыми вакцинамии рациональное применение антимикробных препаратов в сочетании с мониторинговыми исследованиями должны стать значимыми факторами, сдерживающими рост антибиотикорезистентности [20].
Список источников
1. Simell B., Auranen K., Kayhty H., Goldblatt D., Dagan R., O'Brien K. L. The fundamental link between pneumococcal carriage and disease // Expert Review of Vaccines. 2012. Vol. 11, no. 7. P. 841-855.
2. Мартынова А. В., Чулакова О. А., Балабанова Л. А. Микробиологическая характеристика штаммов Streptococcus pneumoniae, выделенных от пациентов пожилого возраста // Забайкальский Медицинский Вестник. 2015. № 2. С. 108-112.
3. Chaguza C., Cornick J. E., Everett D. B. Mechanisms and impact of genetic recombination in the evolution of Streptococcus pneumoniae // Computational and Structural Biotechnology Journal. 2015. Vol. 13. P. 241-247. http://dx.doi.org/10.1016/ j.csbj.2015.03.007.
4. Dickson R. P., Erb-Downward J. R., Martinez F. J., Huffnagle G. B. The microbiome and the respiratory tract // Annual Review of Physiology. 2016. Vol. 78, pp. 481-504. doi: 10.1146/annurev-physiol-021115-105238.
5. Santee C. A., Nagalingam N. A., Faruqi A. A., DeMuri G. P., Gern J. E., Wald E. R., Lynch S. V. Nasopharyngeal microbiota composition of children is related to the frequency of upper respiratory infection and acute sinusitis // Microbiome, 2016, Vol. 4. Article number 34. doi: 10.1186/s40168-016-0179-9.
6. Lysholm F., Wetterbom A., Lindau C., Darban H., Bjerkner A., Fahlander K., Lindberg A. M., Persson B., Allander T., Andersson B. Characterization of the viral microbiome in patients with severe lower respiratory tract infections, using metagenomics sequencing // PLoS One, 2012, Vol. 7, no. 2. e30875. doi: 10.1371/journal.pone.0030875.
7. Geno K. A., Gilbert G. L., Song J. Y., Skovsted I. C., Klugman K. P., Jones Ch., Konradsen H. B., Nahm M. H. Pneumococcal Capsules and Their Types: Past, Present, and Future // Clinical Microbiology Reviews. 2015. Vol. 28, no. 3. P. 871-899.
8. Mayanskiy N., Alyabieva N., Ponomarenko O., Lazareva A., Katosova L., Ivanenko A., Kulichenko T., Baranova L. N.., Baranov A. Serotypes and antibiotic resistance of non-invasive Streptococcus pneumoniae circulating in pediatric hospitals in Moscow, Russia // International Journal of Infectious Diseases. 2014. Vol. 20. P. 58-62.
9. Yother J. Capsules of Streptococcus pneumoniae and Other Bacteria: Paradigms for Polysaccharide Biosynthesis and Regulation // Annual Review of Microbiology. 2011. Vol. 65. P. 563-581.
10. Баязитова Л. Т., Тюпкина О. Ф., Чазова Т. А., Тюрин Ю. А., Исаева Г. Ш., Зарипова А. З., Патяши- на М. А., Авдонина Л. Г., Юзлибаева Л. Р. Внебольничные пневмонии пневмококковой этиологии и микробиологические аспекты назофарингеального носительства Streptococcus pneumoniae у детей в Республике Татарстан // Инфекция и иммунитет. 2017. Т. 7, № 3. С. 271-278. doi: 10.15789/2220-7619-2017-3-271-278.
11. Маянский Н. А., Алябьева Н. М., Пономаренко О. А., Куличенко Т. В., Артемова И. В., Лазарева А. В.,
Бржозовская Е. А., Шамина О. В., Катосова Л. К. Динамика распространенности серотипов и антибиотикорезистентности носоглоточных пневмококков, выделенных у детей в 2010-2016 гг.: результаты ретроспективного ко- гортного исследования // Вопросы Современной Педиатрии. 2017. Т.16, № 5, С. 413-423. doi:
10.15690/vsp.v16i5.1806.
12. МР 4.2.0114-16. Лабораторная диагностика внебольничной пневмонии пневмококковой этиологии. Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека. М., 2016 URL: https://www.rospotrebnadzor.ru/deyatelnost/epidemiological-surveillance/details.php?ELEMENT_ID=7243.
13. Weiser J. N., Ferreira D. M., Paton J. C. Streptococcus pneumoniae: transmission, colonization and invasion // Nature Reviews. Microbiology. 2018. Vol. 16, no. 6. Р. 355-367. doi: 10.1038/s41579-018-0001-8.
14. Kuo C. Y., Hwang K. P., Hsieh Y. C., Cheng C. H., Huang F. L., Shen Y. H., Huang Y. Ch., Chiu Ch. H., Chen P. Y., Lin T. Y. Nasopharyngeal carriage of Streptococcus Pneumoniae in Taiwan before and after the introduction of a conjugate vaccine // Vaccine. 2011. Vol. 29, no. 32. P. 5171-5177. doi: 10.1016/j.vaccine.2011.05.034.
15. Ueno M., Ishii Y., Tateda K., Anahara Y., Ebata A., Lida M., Inamura S., Takahata K., Suzuki Y., Chang B., Wada A., Sugita V., Tanaka T., Nishiwaki Y. Prevalence and risk factors of nasopharyngeal carriage of Streptococcus Pneumoniae in healthy children in Japan // Japanese Journal of Infectious Diseases. 2013. Vol. 66, no. 1. Р. 22-25. doi: 10.7883/yoken.66.22.
16. Hackel M., Lascols C., Bouchillon S., Hilton B., Morgenstern D., Purdy J. Serotype prevalence and antibiotic resistance in Streptococcus pneumoniae clinical isolates among global populations // Vaccine. 2013. Vol. 31, no. 42. P. 4881-4887.
17. Протасова И. Н., Бахарева Н. В., Перьянова О. В., Ильенкова Н. А., Мартынова Г. П., Домрачева С. В., Овчинникова О. П., Елистратова Т. А., Тюшевская О. А., Соколовская Е. С., Сидоренко С. В., Ямамото Т. Молекулярно-эпидемиологическая характеристика и резистентность пневмококков у детей дошкольного возраста // Сибирское медицинское обозрение. 2018. № 3 (111). С. 73-79. doi: 10.20333/2500136-2018-3-73-79.
18. Reshetnikova I. D., Bayazitova L. T., Tupkina O. F., Tyurin Y. A., Shamsutdinov A. F., Kadkina V, Rizvanov A. A. Characteristics of antibiotic resistance nasopharyngeal strains of Streptococcus pneumoniae in children suffering from respiratory pathologies // BioNanoScience. 2017. Vol. 7, no. 1. P 182-185.
19. Pai R., Gertz R. E., Beall B. Sequential multiplex PCR approach for determining capsular serotypes of Streptococcus pneumoniae isolates // Journal of Clinical Microbiology. 2006. Vol. 44, no. 1. P 124-131.
20. Rodenburg G D., de Greeff S. C., Jansen A. G, de Melker H. E., Schouls L. M., Hak E., Spanjaard L., Sanders E. A., van der Ende A. Effects of pneumococcal conjugate vaccine 2 years after its introduction, the Netherlands // Emerging Infectious Diseases. 2010. Vol. 16, no. 5. P 816-823.
References
1. Simell B., Auranen K., Kayhty H., Goldblatt D., Dagan R., O'Brien K. L. The fundamental link between pneumococcal carriage and disease. Expert Review of Vaccines. 2012; 11 (7): 841-855.
2. Martynova A. V., Chulakova O. A., Balabanova L. A. Microbiological characteristics of Streptococcus pneumoniae strains isolated from elderly patients. Zabaykal'skiy meditsinskiy vestnik = Zabaykalsky medical Bulletin. 2015; (2), pp. 108-112. (In Russ.).
3. Chaguza C., Cornick J. E., Everett D. B. Mechanisms and impact of genetic recombination in the evolution of Streptococcus pneumoniae. Computational and Structural Biotechnology Journal. 2015; 13: 241-247. doi: 10.1016 / j.csbj.2015.03.007.
4. Dickson R. P., Erb-Downward J. R., Martinez F. J., Huffnagle G. B. The microbiome and the respiratory tract. Annual Review of Physiology. 2016; 78: 481-504. doi: 10.1146/annurev-physiol-021115-105238.
5. Santee C. A., Nagalingam N. A., Faruqi A. A., DeMuri G. P., Gem J. E., Wald E. R., Lynch S. V. Nasopharyngeal microbiota composition of children is related to the frequency of upper respiratory infection and acute sinusitis. Microbiome. 2016; 4: Article number 34. doi: 10.1186/s40168-016-0179-9.
6. Lysholm F., Wetterbom A., Lindau C., Darban H., Bjerkner A., Fahlander K., Lindberg A. M., Persson B., Allander T., Andersson B. Characterization of the viral microbiome in patients with severe lower respiratory tract infections, using metagenomics sequencing. PLoS One. 2012; 7 (2): e30875. doi: 10.1371/journal.pone.0030875.
7. Geno K. A., Gilbert G. L., Song J. Y., Skovsted I. C., Klugman K. P., Jones Ch., Konradsen H. B., Nahm M. H. Pneumococcal Capsules and Their Types: Past, Present, and Future. Clinical Microbiology Reviews. 2015; 28 (3): 871-899.
8. Mayanskiy N., Alyabieva N., Ponomarenko O., Lazareva A., Katosova L., Ivanenko A., Kulichenko T., Baranova L. N., Baranov A. Serotypes and antibiotic resistance of non-invasive Streptococcus pneumoniae circulating in pediatric hospitals in Moscow, Russia. International Journal of Infectious Diseases. 2014; 20: 58-62.
9. Yother, J. Capsules of Streptococcus pneumoniae and Other Bacteria: Paradigms for Polysaccharide Biosynthesis and Regulation. Annual Review of Microbiology. 2011; 65: 563-581.
10. Bayazitova L. T., Tyupkina O. F., Chazova T. A., Tyurin Y. A., Isaeva G. S., Zaripova A. Z., Patyashina M. A., Avdonina L. G., Yuzlibaeva L. R. Community acquired pneumonia pneumococcal etiology and microbiological aspects of nasopharyngeal carriage in children in the Republic of Tatarstan. Infektsiya i immunitet = Russian Journal of Infection and Immunity. 2017; 7 (3): 271-278. doi: 10.15789/2220-7619-2017-3-271-278. (In Russ.).
11. Mayanskiy N. A., Alyab'eva N. M., Ponomarenko O. A., Kulichenko T. V., Artemova I. V., Lazareva A. V., Brzhozovskaya E. A., Shamina O. V., Katosova L. K. Serotypes and antimicrobial susceptibility of nasopharyngeal pneumococci isolated from children in 2010-2016: A retrospective cohort study. Voprosy sovremennoy pediatrii = Issues of modern Pediatrics. 2017; 16 (5): 413-423.doi: 10.15690/vsp.v16i5.1806. (In Russ.).
12. Laboratory diagnostics of community acquired pneumonia pneumococcal etiology. Federal Service for S u- pervision of Consumer Rights Protection and Human Welfare. Moscow, 2016. URL: https://www.rospotrebnadzor.ru/deyatelnost/epidemiological-surveillance/details.php?ELEMENT_ID=7243. (In Russ.).
13. Weiser J. N., Ferreira D. M., Paton J. C. Streptococcus pneumoniae: transmission, colonization and invasion. Nature Reviews. Microbiology. 2018; 16 (6): 355-367. doi: 10.1038/s41579-018-0001-8.
14. Kuo C. Y., Hwang K. P., Hsieh Y. C., Cheng C. H., Huang F. L., Shen Y. H., Huang Y. Ch., Chiu Ch. H., Chen P. Y., Lin T. Y. Nasopharyngeal carriage of Streptococcus Pneumoniae in Taiwan before and after the introduction of a conjugate vaccine. Vaccine. 2011; 29 (32): 5171-5177. doi: 10.1016/j.vaccine.2011.05.034.
15. Ueno M., Ishii Y., Tateda K., Anahara Y., Ebata A., Lida M., Inamura S., Takahata K., Suzuki Y., Chang B., Wada A., Sugita V., Tanaka T., Nishiwaki Y. Prevalence and risk factors of nasopharyngeal carriage of Streptococcus Pneumoniae in healthy children in Japan. Japanese Journal of Infectious Diseases. 2013; 66 (1): 22-25. doi: 10.7883/yoken.66.22.
16. Hackel M., Lascols C., Bouchillon S., Hilton B., Morgenstern D., Purdy J. Serotype prevalence and antibiotic resistance in Streptococcus pneumoniae clinical isolates among global populations. Vaccine. 2013; 31 (42): 4881-4887.
17. Protasova I. N., Bakhareva N. V., Per'yanova O. V., Il'enkova N. A., Martynova G. P., Domracheva S. V., Ovchinnikova O. P., Elistratova T. A., Tyushevskaya O. A., Sokolovskaya E. S., Sidorenko S. V., Yamamoto T. Molecular- epidemiological characteristics and resistance of pneumococcus in children of preschool age. Sibirskoe meditsinskoe oboz- renie = Siberian medical review. 2018. (3 (111)): 73-79. doi: 10.20333/2500136-2018-3-73-79. (In Russ.).
18. Reshetnikova I. D., Bayazitova L. T., Tupkina O. F., Tyurin Y. A., Shamsutdinov A. F., Kadkina V., Rizvanov A. A. Characteristics of antibiotic resistance nasopharyngeal strains of Streptococcus pneumoniae in children suffering from respiratory pathologies. BioNanoScience. 2017; 7 (1): 182-185. doi: 10.1007/s12668-016-0324-8.
19. Pai R., Gertz R. E., Beall B. Sequential multiplex PCR approach for determining capsular serotypes of Streptococcus pneumoniae isolates. Journal of Clinical Microbiology. 2006; 44 (1): 124-131.
20. Rodenburg G. D., de Greeff S. C., Jansen A. G., de Melker H. E., Schouls L. M., Hak E., Spanjaard L., Sanders E. A., van der Ende A. Effects of pneumococcal conjugate vaccine 2 years after its introduction, the Netherlands. Emerging Infectious Diseases. 2010; 16 (5): 816-823.