Будучи важной средой обитания живых организмов, вода обладает рядом свойств, оказывающих прямое и косвенное влияние на поведение и распространение гидробионтов. В связи с этим выделяют некие оптимальные значения экологических факторов водной среды обитания, способствующие сохранению организмом свойственного для него типа обмена веществ при наименьших энергетических затратах. Но оптимальные значения какого-либо фактора применительно к отдельным функциям организма неодинаковы , в силу этого оптимум в отношении организма в целом - явление комплексное. Поэтому оптимальные условия возникают в тех случаях, когда совокупный эффект проявления всех функций жизнедеятельности позволяет организму в наибольшей степени реализовывать свои возможности роста и развития. Кроме того, наилучшая величина фактора для каждого организма не является постоянной на протяжении жизни. В зависимости от конкретного возраста требования к параметрам среды обитания могут быть весьма различными. Так, например, молодые особи рыб и ракообразных обычно демонстрируют более узкие зоны толерантности, чем их старшие возрастные группы.
Не все экологические факторы абиотической водной среды обладают одинаковой степенью влияния на гидробионтов. Выделяют главные и второстепенные факторы.
К главным факторам принадлежат следущие свойства воды и грунта:
При этом отдельные факторы водной среды в природных условиях воздействуют не изолированно, а совместно. Результатом этого является проявление явления синергизма.
Важнейшим абиотическим фактором водной среды обитания является температура. Именно от температуры находятся в прямой зависимости интенсивность обмена веществ водных организмов, скорость их питания, роста и т.д.
От величины вязкости воды, например, зависит возможность активного передвижения в ней гидробионтов, что способствует к выработке у них различных морфологических приспособлений.
Не менее важным абиотическим фактором является плотность воды, характеризующая условия перемещения организмов и давление на различных горизонтах. По причине наличия выраженного градиента давления в большинстве водоёмов обитатели водной среды обитания в целом способны выдерживать более значительные его колебания, чем жители суши.
Органами восприятия гидростатического давления у гидробионтов служат различные газовые камеры.
Влияние интенсивности солнечного света отражено на окраске гидробионтов. Так, например, рыбы, обитающие в поверхностном слое имею пёструю окраску, в отличие от их глубоководных сородичей, лишенных пигментов. Оптимум освещенности для организмов может сильно меняться при различных температурных условиях в зависимости от концентрации кислорода, активной реакции среды ($pH$) и её окислительно-восстановительного потенциала ($Eh$).
Значительное воздействие на распространенность гидробионтов оказывает соленость воды. Наибольшее распространение в водах Мирового океана получили хлориды, от концентрации которых и зависит разнообразие жизненных форм того или оного объекта гидросферы.
Достаточно высокая концентрация в воде кальция, в ряде случаев способна ослабить летальное воздействие высоких концентраций ионов калия.
Существенное значение для жизни гидробионтов имеют такие характеристики грунта, как размеры слагающих его частиц, плотность их прилегания друг к другу и т.д. Особенно требовательны к характеристикам грунтов водоросли и беспозвоночные.
Таким образом, в экологических исследованиях водных экосистем необходимо по возможности оценивать влияние на организмы как можно большего количества факторов, выявляя степень их значимости и различные эффекты синергизма.