| 1 | ТАРАУ. Микробиология пәні. Зерттеу мақсаты, міндеттері. Даму тарихы | 23 |
| 1.1. | Микробиология пәні және міндеттері | 23 |
| 1.2. | Микробиологияның ғылым ретінде дамуының негізгі кезеңдері | 26 |
| 2 | ТАРАУ. Микроорганизмдер морфологиясы | 36 |
| 2.1. | Микроорганизмдерді жүйелеу мен олардың номенклатурасы | 36 |
| 2.2. | Бактериялардың жіктелуі мен морфологиясы | 37 |
| 2.2.1. | Бактериялар пішіндері | 39 |
| 2.2.2. | Бактерия жасушасының құрылымы | 43 |
| 2.3. | Саңырауқұлақтардың жалпы сипаттамасы | 48 |
| 2.3.1. | Саңырауқұлақтарды жүйелеу (систематика) | 49 |
| 2.4. | Қарапайымдылардың жіктелуі және құрылымы | 51 |
| 2.5. | Вирустардың жалпы сипаттамасы | 53 |
| 2.5.2. | Вирустардың жіктелуі (классификациясы) | 55 |
| 2.5.3. | Вирустардың морфологиясы және биохимиясы | 66 |
| 2.5.4. | Вирустың жасушамен өзара әрекеттесуі | 70 |
| 2.5.5. | Бактериофагтар (бактериялардың вирустары) | 83 |
| 3 | ТАРАУ. Микроорганизмдердің физиологиясы | 86 |
| 3.1. | Бактериялар физиологиясы | 86 |
| 3.1.1. | Бактериялардың қоректенуі | 86 |
| 3.1.2. | Бактериялардың ферменттері | 90 |
| 3.1.3. | Бактерия жасушасының ішіне заттарды тасымалдау механизмі | 90 |
| 3.1.4. | Конструктивті метаболизм | 91 |
| 3.1.5. | Энергетикалық метаболизм | 92 |
| 3.1.6. | Бактериялардың оттегіге қатынасы | 95 |
| 3.1.7. | Бактериялардың өсуі мен көбею тәсілдері | 97 |
| 3.1.8. | Бактерияларды дақылдандыру шарттары | 100 |
| 3.2. | Саңырауқұлақтар мен қарапайымдылар физиологиясының ерекшеліктері | 102 |
| 4 | ТАРАУ. Микробтар генетикасы | 102 |
| 4.1. | Бактериялар геномының құрылысы | 102 |
| 4.1.1. | Бактерия хромосомасы | 102 |
| 4.1.2. | Бактерия плазмидалары | 103 |
| 4.1.3. | Қозғалғыш генетикалық элементтер | 104 |
| 4.1.4. | Мутациялар | 105 |
| 4.1.5. | Бактериялардың рекомбинациясы | 108 |
| 4.2.6. | Вирустар генетикасының ерекшеліктері | 110 |
| 4.3. | Жұқпалы ауруларға диагноз қоюдың генетикалық әдістері | 110 |
| 4.4. | Жұқпалы ауруларға диагноз қоюда гендік әдістерді қолдану | 111 |
| 5 | ТАРАУ. Микробтарға қарсы қолданылатын препараттар | 111 |
| 5.1. | Микробқа қарсы препараттар | 111 |
| 5.2. | Химиотерапевтік препараттар | 112 |
| 5.3. | Антибиотиктер | 113 |
| 5.3.1. | Антибиотиктерді өндіру көздері және алу тәсілдері | 113 |
| 5.3.2. | Микробтарға қарсы синтетикалық химиопрепараттар | 116 |
| 5.3.3. | Микробқа қарсы химиопрепараттардың әсер ету механизмі | 117 |
| 5.3.4. | Антимикробты химиотерапия кезіндегі асқынулар | 120 |
| 5.4. | Микробтардың антибиотиктерге тұрақтылығы | 121 |
| 5.5. | Антибиотиктермен тиімді емдеу негіздері | 124 |
| 5.5.1. | Адам ағзасының тіндеріндегі және сұйық ортадағы | 124 |
| 5.6. | Вирустық инфекцияларды химиялық жолмен емдеу | 125 |
| 5.6.1. | Химиялық препараттар | 127 |
| 5.6.2. | Интерферондар | 132 |
| 5.6.3. | Интерферондардың индукторлары (ИИ) | 136 |
| 5.6.4. | Иммундымодуляторлар | 141 |
| 6 | ТАРАУ. Микроорганизмдер экологиясы | 147 |
| 6.1. | Микробтар экологиясы – микроэкология | 147 |
| 6.1.1. | Топырақ микрофлорасы | 147 |
| 6.1.2. | Су микрофлорасы | 148 |
| 6.1.3. | Ауа микрофлорасы | 149 |
| 6.1.4. | Тағам өнімдерінің микрофлорасы | 149 |
| 6.1.5. | Өсімдіктекті дәрі-дәрмектік шикізат микрофлорасы, фитопатогенді микробтар | 151 |
| 6.1.6. | Өндірістік, тұрмыстық және медициналық зерзаттардың микрофлорасы | 153 |
| 6.1.7. | Табиғаттың заттар айналымындағы микробтар рөлі | 153 |
| 6.2. | Адам организмінің микрофлорасы | 154 |
| 6.2.1. | Адам организмінің микрофлорасының маңыздылығы | 158 |
| 6.2.2. | Дисбактериоз | 160 |
| 6.2.3. | Қоршаған орта факторларының микробтарға әсері | 161 |
| 6.3. | Қоршаған ортада микробтарды жою | 164 |
| 6.3.1. | Стерилизация | 164 |
| 6.3.2. | Дезинфекция | 169 |
| 6.3.3. | Асептика және антисептика | 176 |
| 6.4. | Санитарлық микробиология | 180 |
| 6.4.1. | Су, топырақ, тұрмыстық заттарды микробиологиялық бақылау | 181 |
| 6.4.2. | Ауаны микробиологиялық бақылау | 182 |
| 6.4.3. | Тағам өнімдерін микробиологиялық бақылау | 183 |
| 6.4.4. | Дәрілік заттарды микробиологиялық бақылау | 184 |
| 7. | ТАРАУ. Инфекция туралы ілім | 184 |
| 7.1. | Инфекциялық процесс және жұқпалы ауру | 187 |
| 7.1.2. | Инфекциялық процестің сатылары мен деңгейлері | 187 |
| 7.1.3. | Жұқпалы ауру туралы түсінік | 189 |
| 7.2. | Инфекциялық процесс қоздырғыштары – микробтардың қасиеттері | 190 |
| 7.2.1. | Патогенді, сапрофитті және шартты-патогенді микробтар туралы түсінік | 190 |
| 7.3. | Патогенді микробтардың қасиеттері | 191 |
| 7.3.1. | Микробтардың патогенділік факторлары | 197 |
| 7.3.2. | Бактериялардың токсиндері | 203 |
| 7.3.3. | Патогенділік факторларын генетикалық реттеу | 212 |
| 7.4. | Қоршаған орта факторларының организмнің реактивтілігіне әсері | 215 |
| 7.4.1. | Инфекциялық процесс пайда болуы және дамуындағы макроорганизм реактивтілігінің рөлі | 215 |
| 7.4.2. | Макроорганизмнің реактивтілігіне биологиялық және қоршаған ортаның әлеуметтік факторларының әсері | 220 |
| 7.5. | Жұқпалы аурулар сипатының ерекшеліктері | 224 |
| 7.6. | Инфекциялық процесс түрлері | 228 |
| 7.7. | Вирустарда патогенділік қалыптасудың ерекшеліктері, вирустардың жасушамен өзара әрекеттесуінің түрлері, вирусты инфекциялардың түрлері | 231 |
| 7.8. | Эпидемиялық процесс туралы түсінік | 240 |
| 7.8.1. | Жұқпалы аурулардың экологиялық –эпидемиологиялық классификациясы | 244 |
| 7.8.2. | Конвенциялық (карантиндік) және аса қауіпті инфекциялар туралы түсінік | 246 |
| 8. | ТАРАУ.Иммунитет туралы ілім және бейспецификалық тұрақтылықтың факторлары | 247 |
| 8.1. | Иммунологияға кіріспе | 247 |
| 8.1.1. | Иммунитеттің мәнісі және рөлі | 247 |
| 8.1.2. | Иммунология - жалпы биологиялық және жалпы медициналық ілім саласы | 248 |