Дипломная работа: Идентификация коллекционных культур бактерий современными масс-спектрометрическими и молекулярно-генетическими методами

Внимание! Если размещение файла нарушает Ваши авторские права, то обязательно сообщите нам

39 Stackebrandt E., Rainey F., Ward-Rainey N. Proposal for a new hierarchic classification system Actinobacteria classis now // Int. J. Syst. Bacteriol. 1997.P. 79-491.

40 Welker M., Moore E.R.B. Applications of whole-cell matrix-assisted laser-desorpsion/ionization time-of-flight mass spectrometry in systematic microbiology // Syst. Appl. Microbiol. 2011. V. 18. P.7213-7218.

ПРИЛОЖЕНИЕ 1

Для 36 штаммов методом МАЛДИ масс-спектрометрии были получены масс-спектры клеток на матрице HCCA (a-циано-4-гидроксикоричная кислота).

Рисунок А1 - МАЛДИ масс-спектры целых клеток штаммов №1 и К8

Рисунок А2 - МАЛДИ масс-спектры целых клеток штаммов №7 и К5

Рисунок А3 - МАЛДИ масс-спектры целых клеток штаммов №2 и №6

Рисунок А4 - МАЛДИ масс-спектры целых клеток штаммов №3 и №4

Рисунок А5 - МАЛДИ масс-спектры целых клеток штаммов №5 и Р20

Рисунок А6 - МАЛДИ масс-спектры целых клеток штаммов Р9 и РD4

Рисунок А7 - МАЛДИ масс-спектры целых клеток штаммов 3.15 и 3.16

Рисунок А8 - МАЛДИ масс-спектры целых клеток штаммов 3.17 и 3.25

Рисунок А9 - МАЛДИ масс-спектры целых клеток штаммов 3.26 и 3.28

Рисунок А10- МАЛДИ масс-спектры целых клеток штаммов 3.58 и 3.73

Рисунок А11 - МАЛДИ масс-спектры целых клеток штаммов 3.59 и 3.70

Рисунок А12 - МАЛДИ масс-спектры целых клеток штаммов 3.70 и 3.74

Рисунок А13 - МАЛДИ масс-спектры целых клеток штаммов 3.73 и 3.76

Рисунок А14 - МАЛДИ масс-спектры целых клеток штаммов 3.92 и 3.93

Рисунок А15 - МАЛДИ масс-спектры целых клеток штаммов 3.127 и 3.128

Рисунок А16 - МАЛДИ масс-спектры целых клеток штаммов 3.129 и 3.130

Рисунок А17 - МАЛДИ масс-спектры целых клеток штаммов 3.131 и 3.132

Рисунок А18 - МАЛДИ масс-спектры целых клеток штаммов 3.132 и 3.135

ПРИЛОЖЕНИЕ 2

Обработка данных секвенирования последовательностей фрагментов генов 16S рРНК изолированных штаммов.

Сиквенс фрагмента гена 16S рРНК штамма 3.16

TGAGAGGCGACCGGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGCACAATGGGCGAAAGCCTGATGCAGCGACGCCGCGTGAGGGATGACGGCCTTCGNGTTGTAAACCTCTTTCAGCAGGGAAGAAGCGAAAGTGACNGTACCTGCAGAAGAAGCACCGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGGTGCGAGCGTTGTCCGGAATTATTGGGCGTAAAGAGCTTGTAGGCGGTTTGTCGCGTCTGCTGTGAAAATCCGGGGCTCAACCCCGGACTTGCAGTGGGTACGGGCAGACTAGAGTGTGGTAGGGGAGACTGGAATTCCTGGTGTAGCGGTGAAATGCGCAGATATCAGGAGGAACACCGATGGCGAAGGCAGGTCTCTGGGCCACTACTGACGCTGAGAAGCGAAAGCATGGGGAGCGAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCATGCCGTAAACGTTGGGCGCTAGGTGTGGGACTCATTCCACGAGTTCCGTGCCGCAGCTAACGCATAGCGCCCGCTGG

Сиквенс фрагмента гена 16S рРНК штамма 3.25

CTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATGCAAGTCGAACGGTGAAСGCCCAGCTTGCTGGGTGGATCAGTGGCGAACGGGTGAGTAACACGTGAGCAACCTGCCCCTGACTCTGGGATAAGCGCTGGAAACGGCGTCTAATACTGGATACGAGTAGCGACCGCATGGTCAGTTACTGGAAAGATTTATTGGTTGGGGATGGGCTCGCGGCCTATCAGCTTGTTGGTGAGGTAATGGCTCACCAAGGCGTCGACGGGTAGCCGGCCTGAGAGGGTGACCGGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGCACAATGGGCGCAAGCCTGATGCAGCAACGCCGCGTGAGGGATGACGGCCTTCGGGTTGTAAACCTCTTTTAGCAGGGAAGAAGCGAAAGTGACGGTACCTGCAGAAAAAGCGCCGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGGCGCAAGCGTTATCCGGAATTATTGGGCGTAAAGAGCTCGTAGGCGGTTTGTCGCGTCTGCTGTGAAATCCGGAGGCTCAACCTCCGGCCTGCAGTGGGTACGGGCAGACTAGAGTGCGGTAGGGGAGATTGGAATTCCTGGTGTAGCGGTGGAATGCGCAGATATCAGGAGGAACACCGATGGCGAAGGCAGATCTCTGGGCCGTAACTGACGCTGAGGAGCGAAAGGGTGGGGAGCAAACAGGCTTAGATACCCTGGTAGTCCACCCCGTAAACGTTGGGAACTAGTTGTGGGGTCCATTCCACGGATTCCGTGACGCAGCTAACGCATТAAGTTCCCCGCCTG

Сиквенс фрагмента гена 16S рРНК штамма 3.26

TGAGCAACCTGCCCCTGACTcTGGGATAAGCGCTGGAAACGGCGTCTAATACTGGATTACGAGTAGCGACCGCATGGTCAGTTACTGGAAAGATTTATTGGTTGGGGATGGGCTCGCGGCCTATCAGCTTGTTGGTGAGGTAATGGCTCACCAAGGCGTCGACGGGTAGCCGGCCTGAGAGGGTGACCGGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGCACAATGGGCGCAAGCCTGATGCAGCAACGCCGCGTGAGGGATGACGGCCTTCGGGTTGTAAACCTCTTTTAGCAGGGAAGAAGCGAAAGTGACGGTACCTGCAGAAAAAGCGCCGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGGCGCAAGCGTTATCCGGAATTATTGGGCGTAAAGAGCTCGTAGGCGGTTTGTCGCGTCTGCTGTGAAATCCGGAGGCTCAACCTCCGGCCTGCAGTGGGTACGGGCAGACTAGAGTGCGGTAGGGGAGATTGGAATTCCTGGTGTAGCGGTGGAATGCGCAGATATCAGGAGGAACACCGATGGCGAAGGCAGATCTCTGGGCCGTAACTGACGCTGAGGAGCGAAAGGGTGGGGAGCAAACAGGCTTAGATACCCTGGTAGTCCACCCCGTAAACGTTGGGAACTAGTTGTGGGGTCCATTCCACGGATTCCGTGACGCAGCTAACGCATТAAGTТCCCCGCТTG

Сиквенс фрагмента гена 16S рРНК штамма 3.58

GAGTTTGATCCTGGCTCAGAATGAACGCTGGCGGCATGCCTAACACATGCAAGTCGAACGAAGGCTTCGGCCTTAGTGGCGCACGGGTGCGTAACGCGTGGGAATCTGCCCCTCGGTTCGGAATAACAGTTAGAAATGACTGCTAATACCGGATGATGACGTAAGTCCAAAGATTTATCGCCGAGGGATGAGCCCGCGTAGGATTAGCTAGTTGGTGTGGTAAGAGCGCACCAAGGCGACGATCCTTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGGACAATGGGCGAAAGCCTGATCCAGCAATGCCGCGTGAGTGATGAAGGCCTTAGGGTTGTAAAGCTCTTTTACCCGGGATGATAATGACAGTACCGGGAGAATAAGCTCCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAGGGAGCTAGCGTTATTCGGAATTACTGGGCGTAAAGCGCACGTAGGCGGCTTTGTAAGTAAGAGGTGAAAGCCCAGAGCTCAACTCTGGAATTGCCTTTTAGACTGCATCGCTTGAATCATGGAGAGGTCAGTGGAATTCCGAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATTCGGAAGAACACCAGTGGCGAAGGCGGCTGACTGGACATGTATTGACGCTGAGGTGCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGATAACTAGCTGTCCGGGGACTTGGTCCTTGGGTGGCGCAGCTAACGCATTAAGTTATCCGCCTGGGGAGTACGGCCGCAAGGTTAAAACTCAAATGAATTGACGGGGGCCTGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGCAGAACCTTACCAGCGTTTGACATGGTAGGACGGCTTCCAGAGATGGATTCCTTCCCTTCGGGGACCTACACACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTCGCCTTTAGTTACCATCATTTAGTTGGGTACTCTAAAGGAACCGCCGGTGATAAGCCGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCCTCATGGCCCTTACGCGCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCAACTACAGTGGGCAGCAATCCCGCGAGGGTGAGCTAATCTCCAAAAGTTGTCTCAGTTCGGATTGTTCTCTGCAACTCGAGAGCATGAAGGCGGAATCGCTAGTAATCGCGGATCAGCATGCCGCGGTGAATACGTTCCCAGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTGGATTCACCCGAAGGCGTCGCGCTAACCGCAAGGAGGCAGGCGACCACGGTGGGTTTAGCGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTA

Сиквенс фрагмента гена 16S рРНК штамма 3.93

GGTАGCCGGCCTGAGAGGGTGACCGGCCACAАTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGCACAATGGGCGAAAGCCTGATGCAGCGACGCCGCGTGAGGGAСGAAGGCCTTCGGGTTGTAAACCTCTTTCAGCAGGGAAGAAGCGAAAGTGACGGTACCTGCAGAAGAAGCGCCGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGGCGCAAGCGTTATCCGGAATTATTGGGCGTAAAGAGCTCGTAGGCGGTTTGTCGCGTCTGCTGTGAAAGCCCGGGGCTCAACCCCGGGTCTGCAGTGGGTACGGGCAGACTAGAGTGCAGTAGGGGAGACTGGAATTCCTGGTGTAGCGGTGAAATGCGCAGATATCAGGAGGAACACCGATGGCGAAGGCAGGTCTCTGGGCTGTAACTGACGCTGAGGAGCGAAAGCATGGGGAGCGAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCATGCCGTAAACGTTGGGCACTAGGTGTGGGGGACATTCCACGTTTTCCGCGCCGTAGCTAACGCATTAAGTGCCCCGCСT

Сиквенс фрагмента гена 16S рРНК штамма 3.129

GACCAGCCACATTGGGACTGAGACACGGCCCAAACTCATACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATCTTGCGCAATGGGCGAAAGCCTGACGCAGCCATGCCGCGTGAATGATGAAGGTCTTAGGATTGTAAAATTCTTTCACCGGGGACGATAATGACGGTACCCGGAGAAGAAGCCCCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGAAGGGGGCTAGCGTTGCTCGGAATTACTGGGCGTAAAGGGCGCGTAGGCGGACATTTAAGTCAGGGGTGAAATCCCAGAGCTCAACTCTGGAACTGCCTTTGATACTGGGTGTCTTGAGTGTGAGAGAGGTATGTGGAACTCCGAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATTCGGAAGAACACCAGTGGCGAAGGCGACATACTGGCTCATTACTGACGCTGAGGCGCGAAAGCGTGGGGAGCAAACaGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGATTGCTAGTTGTgCGGGCTGCATGCAGTT

Сиквенс фрагмента гена 16S рРНК штамма 3.131

TCTGGCTCAGAGCGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGAAGTCTTCGGACTTAGTGGCGGACGGGTGAGTAACACGTGGGAACGTGCCCTTTGGTACGGAATAACTCAGGGAAACTTGAGCTAATACCGTATGTGCCCTTCGGGGGAAAGATTTATCGCCATTGGAGCGGCCCGCGTCTGATTAGCTAGTTGGTGGTGTAATGGACCACCAAGGCGACGATCAGTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACATTGGGACTGAGACACGGCCCAAACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATCTTGCGCAATGGGCGAAAGCCTGACGCAGCCATGCCGCGTGAATGATGAAGGTCTTAGGATTGTAAAATTCTTTCACCGGGGACGATAATGACGGTACCCGGAGAAGAAGCCCCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGAAGGGGGCTAGCGTTGCTCGGAATTACTGGGCGTAAAGGGAGCGTAGGCGGACATTTAAGTCAGGGGTGAAATCCCGGGGCTCAACCTCGGAATTGCCTTTGATACTGGGTGTCTTGAGTATGAGAGAGGTGTGTGGAACTCCGAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATTCGGAAGAACACCAGTGGCGAAGGCGACACACTGGCTCATTACTGACGCTGAGGCTCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGATTGCTAGTTGTCGGGATGCATGCATTTCGGTGACGCAGCTAACGCATTAAGCAATCCGCCTGG

Сиквенс фрагмента гена 16S рРНК штамма 3.134

TСCTGGCTCAGAGCGAACGCTGGCGGAATGCTTAACACATGCAAGTCGCACGGGGGCTTCGGCTCGAGTGGCGGACGGGTGAGTAACGCGTAGGAACGTGTCTTGGGGTGGGGGATAACGCTGGGAAACTGGCGCTAATACCGCATATGGGCTGAGGCCCAAAGCCTTCGGGTGCCTTGAGAGCGGCCTGCGTCCGATTAGCTAGTTGGTGGGGTAAAGGCTTACCAAGGCGTCGATCGGTAGCTGGTCTGAGAGGACGATCAGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGGACAATGGGCGCAAGCCTGATCCAGCAATTCCGCGTGGGTGAAGAAGGTCTTCGGATTGTAAAGCCCTTTCGACAGGGACGATGATGACGGTACCTGTAGAAGAAGCCCCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGAAGGGGGCTAGCGTTGCTCGGAATTACTGGGCGTAAAGGGCGCGTAGGCGGCGGTGTTAGTCAGGCGTGAAATTCCTGGGCTCAACCTGGGGACTGCGCTTGATACGGCATTGCTTGAGGATGGAAGAGGCTCGCGGAATTCCCAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATTGGGAAGAACACCGGTGGCGAAGGCGGCGAGCTGGTCCATTACTGACGCTGAGGCGCGACAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGTGCGCTGGATGTTGGGTGGCCTAGCCACTCAGTGTCGTAGCTAАCGCGGТAAGCGCАCCGCCTGG

Сиквенс фрагмента гена 16S рРНК штамма 3.135

TTGGGGATGGGCTCGCGGCCTATCAGCTTGTTGGTGAGGTAATGGCTCACCAAgGCGTCGACGGGTAGCCGGCCTGAGAGGGTGACCGGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGCACAATGGGCGCAAGCCTGATGCAGCAACGCCGCGTGAGGGATGACGGCCTTCGGGTTGTAAACCTCTTTTAGCAGGGAAGAAGCGAAAGTGACGGTACCTGCAGAAAAAGCGCCGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGGCGCAAGCGTTATCCGGAATTATTGGGCGTAAAGAGCTCGTAGGCGGTTTGTCGCGTCTGCTGTGAAATCCGGAGGCTCAACCTCCGGCCTGCAGTGGGTACGGGCAGACTAGAGTGCGGTAGGGGAGATTGGAATTCCTGGTGTAGCGGTGGAATGCGCAGATATCAGGAGGAACACCGATGGCGAAGGCAGATCTCTGGGCCGTAACTGACGCTGAGGAGCGAAAGGGTGGGGAGCAAACAGGCTTAGATACCCTGGTAGTCCACCCCGTAAACGTTGGGAACTAGTTGTGGGGTCCATTCCACGGATTCCGTGACGCAGCTAACGCATtAAGTTCCCCGCTGG

Сиквенс фрагмента гена 16S рРНК штамма №6

GGGGGACAACGTTTcGAAAGGAACGCTAATACCGCATACGTCCTACGGGAGAAAGCAGGGGACCTTCGGGCCTTGCGCTATCAGATGAGCCTAGGTCGGATTAGCTAGTTGGTGAGGTAAAGGCTCACCAAGGCGACGATCCGTAACTGGTCTGAGAGGATGATCAGTCACACTGGAACTGAGACACGGTCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGGACAATGGGYGAAAGCCTGATCCAGCCATGCCGCGTGTGTGAAGAAGGTCTTCGGATTGTAAAGCACTTTAAGTTGGGAGGAAGGGCAGTAAGCTAATACCTTGCTGTTTTGACGTTACCGACAGAATAAGCACCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGAAGGGTGCAAGCGTTAATCGGAATTACTGGGCGTAAAGCGCGCGTAGGTGGTTCGTTAAGTTGGATGTGAAAGCCCCGGGCTCAACCTGGGAACTGCATCCAAAACTGGCGAGCTAGAGTATGGCAGAGGGTGGTGGAATTTCCTGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGATATAGGAAGGAACACCAGTGGCGAAGGCGACCACCTGGGCTAATACTGACACTGAGGTGCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGTCGACTAGCCGTTGGGATCCTTGAGATCTTAGTGGCGCAGCTAACGCaTTAAGT

Сиквенс фрагмента гена 16S рРНК штамма 8(P9)

CcTATGAGAcTGGGATAACTCCGGGAAACCGGGGGCTAATACCGGATAATTCTTTTCTACACATGTAGAAAAGCTGAAAGATGGTTTCGGCTATCACTCATAGATGGGCCCGCGGCGCATTAGCTAGTTGGTGAGGTAACGGCTCACCAAGGCGACGATGCGTAGCCGACCTGAGAGGGTGATCGGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTAGGGAATCTTCCGCAATGGACGAAAGTCTGACGGAGCAACGCCGCGTGAGTGATGAAGGTTTTCGGATCGTAAAACTCTGTTGTTAGGGAAGAACAAGTACCGGAGTAACTGCCGGTACCTTGACGGTACCTAACCAGAAAGCCACGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGTGGCAAGCGTTGTCCGGAATTATTGGGCGTAAAGCGCGCGCAGGTGGTCTCTTAAGTCTGATGTGAAAGCCCCCGGCTCAACCGGGGAGGGTCATTGGAAACTGGGAGACTTGAGTGCAGGAGAGAAGAGTGGAATTCCACGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGAGATGTGGAGGAACACCAGTGGCGAAGGCGACTCTTTGGCCTGTAACTGACACTGAGGCGCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGAGTGCTAAGTGTTAGAGGGTTTCCGCCCTTTAGTGCTGCAGCAAACGCATTAАGCAСTCCGCСTGG

Источник: https://otherreferats.allbest.ru/download/615587/