141. Kostrikis, L. G., Tyagi, S., Mhlanga, M. M., Ho, D. D. & Kramer, F. R. (1998) Science 279, 1228-9.
142. Stryer, L. (1978) Annu Rev Biochem 47, 819-46.
143. Johnson, A. E. (2005) Traffic 6, 1078-92.
144. Kim, H., Kane, M. D., Kim, S., Dominguez, W., Applegate, B. M. & Savikhin, S. (2006) Biosens Bioelectron.
145. Baker, E. S., Hong, J. W., Gaylord, B. S., Bazan, G. C. & Bowers, M. T. (2006) J Am Chem Soc 128, 8484-92.
146. Wahlroos, R., Toivonen, J., Tirri, M. & Hanninen, P. (2006) J Fluoresc 16, 379-86.
147. Okamura, Y. & Watanabe, Y. (2006) Methods Mol Biol 335, 43-56.
148. Piatek, A. S., Tyagi, S., Pol, A. C., Telenti, A., Miller, L. P., Kramer, F. R. & Alland, D. (1998) Nat Biotechnol 16, 359-63.
149. Marras, S. A., Kramer, F. R. & Tyagi, S. (1999) Genet Anal 14, 151-6.
150. Tyagi, S., Bratu, D. P. & Kramer, F. R. (1998) Nat Biotechnol 16, 49-53.
151. Vet, J. A., Majithia, A. R., Marras, S. A., Tyagi, S., Dube, S., Poiesz, B. J. & Kramer, F. R. (1999) Proc Natl Acad Sci U S A 96, 6394-9.
152. Steemers, F. J., Ferguson, J. A. & Walt, D. R. (2000) Nat Biotechnol 18, 91-4.
153. Liu, X. & Tan, W. (1999) Anal Chem 71, 5054-9.
154. Liu, X., Farmerie, W., Schuster, S. & Tan, W. (2000) Anal Biochem 283, 56-63.
155. Sokol, D. L., Zhang, X., Lu, P. & Gewirtz, A. M. (1998) Proc Natl Acad Sci U S A 95, 11538-43.
156. Gore, H. M., Wakeman, C. A., Hull, R. M. & McKillip, J. L. (2003) Biochem Biophys Res Commun 311, 386-90.
157. Henry, K. M., Jiang, J., Rozmajzl, P. J., Azad, A. F., Macaluso, K. R. & Richards, A. L. (2006) Mol Cell Probes.
158. Patel, J. R., Bhagwat, A. A., Sanglay, G. C. & Solomon, M. B. (2006) Food Microbiol 23, 39-46.
159. Dubertret, B., Calame, M. & Libchaber, A. J. (2001) Nat Biotechnol 19, 365-70.
160. Stoermer, R. L. & Keating, C. D. (2006) J Am Chem Soc 128, 13243-54.
161. Tyagi, S., Marras, S. A. & Kramer, F. R. (2000) Nat Biotechnol 18, 1191-6.
162. Gubala, A. J. & Proll, D. F. (2006) Appl Environ Microbiol 72, 6424-8.
163. Balashov, S. V., Park, S. & Perlin, D. S. (2006) Antimicrob Agents Chemother 50, 2058-63.
164. Sinsimer, D., Leekha, S., Park, S., Marras, S. A., Koreen, L., Willey, B., Naidich, S., Musser, K. A. & Kreiswirth, B. N. (2005) J Clin Microbiol 43, 4585-91.
165. Whitcombe, D., Theaker, J., Guy, S. P., Brown, T. & Little, S. (1999) Nat Biotechnol 17, 804-7.
166. Thelwell, N., Millington, S., Solinas, A., Booth, J. & Brown, T. (2000) Nucleic Acids Res 28, 3752-61.
167. Todd, A. V., Fuery, C. J., Impey, H. L., Applegate, T. L. & Haughton, M. A. (2000) Clin Chem 46, 625-30.
168. Stojanovic, M. N., de Prada, P. & Landry, D. W. (2001) Chembiochem 2, 411-5.
169. Chang, I. H., Tulock, J. J., Liu, J., Kim, W. S., Cannon, D. M., Jr., Lu, Y., Bohn, P. W., Sweedler, J. V. & Cropek, D. M. (2005) Environ Sci Technol 39, 3756-61.
170. Liu, J. & Lu, Y. (2006) Methods Mol Biol 335, 275-88.
171. Seo, Y. J., Jeong, H. S., Bang, E. K., Hwang, G. T., Jung, J. H., Jang, S. K. & Kim, B. H. (2006) Bioconjug Chem 17, 1151-5.
172. Hacia, J. G. (1999) Nat Genet 21, 42-7.
173. Zhao, X., Nampalli, S., Serino, A. J. & Kumar, S. (2001) Nucleic Acids Res 29, 955-9.
174. Ortiz, E., Estrada, G. & Lizardi, P. M. (1998) Mol Cell Probes 12, 219-26.
175. Wang, H., Xing, J., Grover, D., Hedges, D. J., Han, K., Walker, J. A. & Batzer, M. A. (2005) J Mol Biol 354, 994-1007.
176. Du, H., Strohsahl, C. M., Camera, J., Miller, B. L. & Krauss, T. D. (2005) J Am Chem Soc 127, 7932-40.
177. Vicens, M. C., Sen, A., Vanderlaan, A., Drake, T. J. & Tan, W. (2005) Chembiochem 6, 900-7.
178. Nelson, D. L., Ledbetter, S. A., Corbo, L., Victoria, M. F., Ramirez-Solis, R., Webster, T. D., Ledbetter, D. H. & Caskey, C. T. (1989) Proc Natl Acad Sci U S A 86, 6686-90.
179. Aslanidis, C. & de Jong, P. J. (1991) Proc Natl Acad Sci U S A 88, 6765-9.
180. Sambrook, J. & Russell, D. W. (2001) Molecular Cloning: A practical Manual. (CSHL Press, Cold Spring Harbour).
181. Lovett, M., Kere, J. & Hinton, L. M. (1991) Proc Natl Acad Sci U S A 88, 9628-32.
182. Parimoo, S., Patanjali, S. R., Shukla, H., Chaplin, D. D. & Weissman, S. M. (1991) Proc Natl Acad Sci U S A 88, 9623-7.
183. Brookes, A. J., Slorach, E. M., Morrison, K. E., Qureshi, S. J., Blake, D., Davies, K. & Porteous, D. J. (1994) Hum Mol Genet 3, 2011-7.
184. Luk'ianov, S. A., Gurskaia, N. G., Luk'ianov, K. A., Tarabykin, V. S. & Sverdlov, E. D. (1994) Bioorg Khim 20, 701-4.
185. Buzdin, A., Kovalskaya-Alexandrova, E., Gogvadze, E. & Sverdlov, E. (2006) J Virol 80, 10752-62.
186. Qiu, P., Soder, G. J., Sanfiorenzo, V. J., Wang, L., Greene, J. R., Fritz, M. A. & Cai, X. Y. (2003) Biochem Biophys Res Commun 309, 331-8.
187. Guo, D. C., Qi, Y., He, R., Gupta, P. & Milewicz, D. M. (2003) Biotechnol Lett 25, 1703-7.
188. Cotton, R. G. (1999) Genet Anal 14, 165-8.
189. Taylor, G. R. (1999) Electrophoresis 20, 1125-30.
190. Cotton, R. G., Rodrigues, N. R. & Campbell, R. D. (1988) Proc Natl Acad Sci U S A 85, 4397-401.
191. Roberts, E., Deeble, V. J., Woods, C. G. & Taylor, G. R. (1997) Nucleic Acids Res 25, 3377-8.
192. Rowley, G., Saad, S., Giannelli, F. & Green, P. M. (1995) Genomics 30, 574-82.
193. Bui, C. T., Lambrinakos, A., Babon, J. J. & Cotton, R. G. (2003) BMC Chem Biol 3, 1.
194. Lambrinakos, A., Yakubovskaya, M., Babon, J. J., Neschastnova, A. A., Vishnevskaya, Y. V., Belitsky, G. A., D'Cunha, G., Horaitis, O. & Cotton, R. G. (2004) Hum Mutat 23, 186-92.
195. Deeble, V. J., Roberts, E., Robinson, M. D., Woods, C. G., Bishop, D. T. & Taylor, G. R. (1997) Genet Test 1, 253-9.
196. Yeung, A. T., Hattangadi, D., Blakesley, L. & Nicolas, E. (2005) Biotechniques 38, 749-58.
197. Sun, H., Yabuki, A. & Maizels, N. (2001) Proc Natl Acad Sci U S A 98, 12444-9.
198. Mashal, R. D., Koontz, J. & Sklar, J. (1995) Nat Genet 9, 177-83.
199. Birkenkamp, K. & Kemper, B. (1995) DNA Res 2, 9-14.
200. Youil, R., Kemper, B. W. & Cotton, R. G. (1995) Proc Natl Acad Sci U S A 92, 87-91.
201. Kosak, H. G. & Kemper, B. W. (1990) Eur J Biochem 194, 779-84.
202. Surdi, G. A., Yaar, R. & Smith, C. L. (1999) Genet Anal 14, 177-9.
203. Inganas, M., Byding, S., Eckersten, A., Eriksson, S., Hultman, T., Jorsback, A., Lofman, E., Sabounchi, F., Kressner, U., Lindmark, G. & Tooke, N. (2000) Clin Chem 46, 1562-73.
204. Golz, S., Birkenkamp-Demtroder, K. & Kemper, B. (1998) Nucleic Acids Res 26, 1132-3.
205. Del Tito, B. J., Jr., Poff, H. E., 3rd, Novotny, M. A., Cartledge, D. M., Walker, R. I., 2nd, Earl, C. D. & Bailey, A. L. (1998) Clin Chem 44, 731-9.
206. Smith, M. J., Humphrey, K. E., Cappai, R., Beyreuther, K., Masters, C. L. & Cotton, R. G. (2000) Mol Diagn 5, 67-73.
207. Schmalzing, D., Belenky, A., Novotny, M. A., Koutny, L., Salas-Solano, O., El-Difrawy, S., Adourian, A., Matsudaira, P. & Ehrlich, D. (2000) Nucleic Acids Res 28, E43.
208. Shi, R., Otomo, K., Yamada, H., Tatsumi, T. & Sugawara, I. (2006) Microbes Infect 8, 128-35.
209. Oleykowski, C. A., Bronson Mullins, C. R., Godwin, A. K. & Yeung, A. T. (1998) Nucleic Acids Res 26, 4597-602.
210. Qiu, P., Shandilya, H., D'Alessio, J. M., O'Connor, K., Durocher, J. & Gerard, G. F. (2004) Biotechniques 36, 702-7.
211. Mitani, N., Tanaka, S. & Okamoto, Y. (2006) Clin Lab 52, 385-6.
212. Sokurenko, E. V., Tchesnokova, V., Yeung, A. T., Oleykowski, C. A., Trintchina, E., Hughes, K. T., Rashid, R. A., Brint, J. M., Moseley, S. L. & Lory, S. (2001) Nucleic Acids Res 29, E111.
213. Comai, L., Young, K., Till, B. J., Reynolds, S. H., Greene, E. A., Codomo, C. A., Enns, L. C., Johnson, J. E., Burtner, C., Odden, A. R. & Henikoff, S. (2004) Plant J 37, 778-86.
214. Ford, M. E. & Whitcomb, D. C. (1999) Mol Diagn 4, 211-8.
215. Bannwarth, S., Procaccio, V. & Paquis-Flucklinger, V. (2005) Hum Mutat 25, 575-82.
216. Youil, R., Toner, T. J., Bull, E., Bailey, A. L., Earl, C. D., Dietz, H. C. & Montgomery, R. A. (2000) Hum Mutat 16, 92-3.
217. Shi, C., Eshleman, S. H., Jones, D., Fukushima, N., Hua, L., Parker, A. R., Yeo, C. J., Hruban, R. H., Goggins, M. G. & Eshleman, J. R. (2004) Nat Methods 1, 141-7.
218. Qiu, P., Shandilya, H. & Gerard, G. F. (2005) Mol Biotechnol 29, 11-8.
219. Fuhrmann, M., Oertel, W., Berthold, P. & Hegemann, P. (2005) Nucleic Acids Res 33, e58.
220. Huang, J., Kirk, B., Favis, R., Soussi, T., Paty, P., Cao, W. & Barany, F. (2002) Oncogene 21, 1909-21.
221. Goldrick, M. M. (2001) Hum Mutat 18, 190-204.
222. Till, B. J., Burtner, C., Comai, L. & Henikoff, S. (2004) Nucleic Acids Res 32, 2632-41.
223. Che, Y. & Chen, X. (2004) Anal Biochem 329, 220-9.
224. Zhu, D., Xing, D., Shen, X. & Liu, J. (2004) Biochem Biophys Res Commun 324, 964-9.
225. Shagin, D. A., Rebrikov, D. V., Kozhemyako, V. B., Altshuler, I. M., Shcheglov, A. S., Zhulidov, P. A., Bogdanova, E. A., Staroverov, D. B., Rasskazov, V. A. & Lukyanov, S. (2002) Genome Res 12, 1935-42.
226. Lloyd, A., Plaisier, C. L., Carroll, D. & Drews, G. N. (2005) Proc Natl Acad Sci U S A 102, 2232-7.
227. Nakatsukasa, T., Shiraishi, Y., Negi, S., Imanishi, M., Futaki, S. & Sugiura, Y. (2005) Biochem Biophys Res Commun 330, 247-52.
228. Fiammengo, R. & Jaschke, A. (2005) Curr Opin Biotechnol 16, 614-21.
229. Parsons, B. L., McKinzie, P. B. & Heflich, R. H. (2005) Methods Mol Biol 291, 235-45.
230. Gale, J. M. & Tafoya, G. B. (2004) Photochem Photobiol 79, 461-9.
231. Shively, L., Chang, L., LeBon, J. M., Liu, Q., Riggs, A. D. & Singer-Sam, J. (2003) Biotechniques 34, 498-502, 504.
232. Easterday, W. R., Van Ert, M. N., Zanecki, S. & Keim, P. (2005) Biotechniques 38, 731-5.
233. Diebold, R., Bartelt-Kirbach, B., Evans, D. G., Kaufmann, D. & Hanemann, C. O. (2005) J Mol Diagn 7, 97-104.
234. Baum, L., Ng, A. & Leung, W. K. (2005) Mol Cell Probes 19, 163-8.
235. Behrensdorf, H. A., Pignot, M., Windhab, N. & Kappel, A. (2002) Nucleic Acids Res 30, e64.
236. Bi, L. J., Zhou, Y. F., Zhang, X. E., Deng, J. Y., Zhang, Z. P., Xie, B. & Zhang, C. G. (2003) Anal Chem 75, 4113-9.
237. Su, X., Robelek, R., Wu, Y., Wang, G. & Knoll, W. (2004) Anal Chem 76, 489-94.
238. Golz, S. & Kemper, B. (1999) Nucleic Acids Res 27, e7.
239. O'Donnell, K. A., Tighe, O., O'Neill, C., Naughten, E., Mayne, P. D., McCarthy, T. V., Vaughan, P. & Croke, D. T. (2001) Hum Mutat 17, 432.
240. Vaughan, P. & McCarthy, T. V. (1999) Genet Anal 14, 169-75.
241. Vaughan, P. & McCarthy, T. V. (1998) Nucleic Acids Res 26, 810-5.
242. Li, J., Chu, X., Liu, Y., Jiang, J. H., He, Z., Zhang, Z., Shen, G. & Yu, R. Q. (2005) Nucleic Acids Res 33, e168.
243. Bocker, S. (2003) Bioinformatics 19 Suppl 1, i44-53.
244. Maruyama, T., Takata, T., Ichinose, H., Park, L. C., Kamaiya, N. & Goto, M. (2003) Biotechnol Lett 25, 1637-41.
245. Maekawa, M., Nagaoka, T., Taniguchi, T., Higashi, H., Sugimura, H., Sugano, K., Yonekawa, H., Satoh, T., Horii, T., Shirai, N., Takeshita, A. & Kanno, T. (2004) Clin Chem 50, 1322-7.
246. Gupta, V., Arora, R., Ranjan, A., Bairwa, N. K., Malhotra, D. K., Udhayasuriyan, P. T., Saha, A. & Bamezai, R. (2005) Methods Mol Biol 291, 247-61.
247. Maitra, A., Cohen, Y., Gillespie, S. E., Mambo, E., Fukushima, N., Hoque, M. O., Shah, N., Goggins, M., Califano, J., Sidransky, D. & Chakravarti, A. (2004) Genome Res 14, 812-9.
248. Patolsky, F., Lichtenstein, A. & Willner, I. (2001) Nat Biotechnol 19, 253-7.
249. Nagayama, K., Enomoto, N., Miyasaka, Y., Kurosaki, M., Chen, C. H., Sakamoto, N., Nakagawa, M., Sato, C., Tazawa, J., Ikeda, T., Izumi, N. & Watanabe, M. (2001) Am J Gastroenterol 96, 2211-7.
250. Hames, B. D. & Higgins, S. J. (1985) (IRL Press, Oxford, Washington DC).
251. Buzdin, A., Ustyugova, S., Khodosevich, K., Mamedov, I., Lebedev, Y., Hunsmann, G. & Sverdlov, E. (2003) Genomics 81, 149-56.
252. Mamedov, I. Z., Arzumanyan, E. S., Amosova, A. L., Lebedev, Y. B. & Sverdlov, E. D. (2005) Nucleic Acids Res 33, e16.
253. Buzdin, A., Gogvadze, E., Kovalskaya, E., Volchkov, P., Ustyugova, S., Illarionova, A., Fushan, A., Vinogradova, T. & Sverdlov, E. (2003) Nucleic Acids Res 31, 4385-90.
254. Buzdin, A. A., Lebedev Iu, B. & Sverdlov, E. D. (2003) Bioorg. Khim. 29, 103-106.
255. Lisitsyn, N. A., Segre, J. A., Kusumi, K., Lisitsyn, N. M., Nadeau, J. H., Frankel, W. N., Wigler, M. H. & Lander, E. S. (1994) Nat Genet 6, 57-63.
256. Mouritzen, P., Nielsen, A. T., Pfundheller, H. M., Choleva, Y., Kongsbak, L. & Moller, S. (2003) Expert Rev Mol Diagn 3, 27-38.
257. Matz, M., Shagin, D., Bogdanova, E., Britanova, O., Lukyanov, S., Diatchenko, L. & Chenchik, A. (1999) Nucleic Acids Res 27, 1558-1560.
258. Lavrentieva, I., Khil, P., Vinogradova, T., Akhmedov, A., Lapuk, A., Shakhova, O., Lebedev, Y., Monastyrskaya, G. & Sverdlov, E. D. (1998) Hum Genet 102, 107-116.
259. Lebedev, Y., Belonovich, O., Zybrova, N., Khil, P., Kurdyukov, S., Vinogradova, T., Hunsmann, G. & Sverdlov, E. (2000) Gene 247, 265-277.
260. Mamedov, I., Batrak, A., Buzdin, A., Arzumanyan, E., Lebedev, Y. & Sverdlov, E. D. (2002) Nucleic Acids Res 30, e71.
261. Medstrand, P. & Mager, D. L. (1998) J Virol 72, 9782-9787.
262. Barbulescu, M., Turner, G., Seaman, M. I., Deinard, A. S., Kidd, K. K. & Lenz, J. (1999) Curr Biol 9, 861-868.
263. Turner, G., Barbulescu, M., Su, M., Jensen-Seaman, M. I., Kidd, K. K. & Lenz, J. (2001) Curr Biol 11, 1531-5.
264. Sverdlov, E. D. (2000) Bioessays 22, 161-171.
265. Mamedov, I., Lebedev, Y., Hunsmann, G., Khusnutdinova, E. & Sverdlov, E. (2004) Genomics 84, 596-9.
266. Domansky, A. N., Kopantzev, E. P., Snezhkov, E. V., Lebedev, Y. B., Leib-Mosch, C. & Sverdlov, E. D. (2000) FEBS Lett 472, 191-195.
267. Domanskii, A. N., Akopov, S. B., Lebedev Iu, B., Nikolaev, L. G. & Sverdlov, E. D. (2002) Bioorg Khim 28, 341-5.
268. Ruda, V. M., Akopov, S. B., Trubetskoy, D. O., Manuylov, N. L., Vetchinova, A. S., Zavalova, L. L., Nikolaev, L. G. & Sverdlov, E. D. (2004) Virus Res 104, 11-6.
269. Kazazian, H. H., Jr. (2000) Science 289, 1152-1153.
270. Smit, A. F., Toth, G., Riggs, A. D. & Jurka, J. (1995) J Mol Biol 246, 401-417.
271. Mills, R. E., Bennett, E. A., Iskow, R. C., Luttig, C. T., Tsui, C., Pittard, W. S. & Devine, S. E. (2006) Am J Hum Genet 78, 671-9.
272. Boissinot, S., Chevret, P. & Furano, A. V. (2000) Mol Biol Evol 17, 915-28.
273. Boissinot, S., Entezam, A., Young, L., Munson, P. J. & Furano, A. V. (2004) Genome Res 14, 1221-31.
274. Ovchinnikov, I., Troxel, A. B. & Swergold, G. D. (2001) Genome Res 11, 2050-8.
275. Pickeral, O. K., Makalowski, W., Boguski, M. S. & Boeke, J. D. (2000) Genome Res 10, 411-5.
276. Goodier, J. L., Ostertag, E. M. & Kazazian, H. H., Jr. (2000) Hum Mol Genet 9, 653-7.
277. Jurka, J. (1998) Curr Opin Struct Biol 8, 333-7.
278. Jurka, J. (1997) Proc Natl Acad Sci U S A 94, 1872-7.
279. Smit, A. F. (1999) Curr Opin Genet Dev 9, 657-663.
280. Wei, W., Gilbert, N., Ooi, S. L., Lawler, J. F., Ostertag, E. M., Kazazian, H. H., Boeke, J. D. & Moran, J. V. (2001) Mol Cell Biol 21, 1429-39.
281. Hohjoh, H. & Singer, M. F. (1996) Embo J 15, 630-9.
282. Gogvadze, E. V., Buzdin, A. A. & Sverdlov, E. D. (2005) Bioorg Khim 31, 82-9.
283. Buzdin, A., Ustyugova, S., Gogvadze, E., Vinogradova, T., Lebedev, Y. & Sverdlov, E. (2002) Genomics 80, 402-6.
284. Gogvadze, E. V. & Buzdin, A. A. (2005) Mol Biol (Mosk) 39, 364-73.
285. Gogvadze, E., Barbisan, C., Lebrun, M. H. & Buzdin, A. (2007) BMC Genomics 8, 360.
286. Temin, H. M. (1993) Proc Natl Acad Sci U S A 90, 6900-6903.
287. Kandel, E. S. & Nudler, E. (2002) Mol Cell 10, 1495-502.
288. Swanstrom, R., Parker, R. C., Varmus, H. E. & Bishop, J. M. (1983) Proc Natl Acad Sci U S A 80, 2519-23.
289. Jamain, S., Girondot, M., Leroy, P., Clergue, M., Quach, H., Fellous, M. & Bourgeron, T. (2001) Genomics 78, 38-45.
290. Nishihara, H., Smit, A. F. & Okada, N. (2006) Genome Res 16, 864-74.
291. Hayward, B. E., Zavanelli, M. & Furano, A. V. (1997) Genetics 146, 641-54.
292. Furano, A. V. (2000) Prog Nucleic Acid Res Mol Biol 64, 255-94.
293. Bibillo, A. & Eickbush, T. H. (2004) J Biol Chem 279, 14945-53.
294. Gilbert, N., Lutz, S., Morrish, T. A. & Moran, J. V. (2005) Mol Cell Biol 25, 7780-95.
295. Babushok, D. V., Ostertag, E. M., Courtney, C. E., Choi, J. M. & Kazazian, H. H., Jr. (2006) Genome Res 16, 240-50.
296. Fudal, I., Bohnert, H. U., Tharreau, D. & Lebrun, M. H. (2005) Fungal Genet Biol 42, 761-72.
297. Verheggen, C., Lafontaine, D. L., Samarsky, D., Mouaikel, J., Blanchard, J. M., Bordonne, R. & Bertrand, E. (2002) Embo J 21, 2736-45.
298. Ganot, P., Jady, B. E., Bortolin, M. L., Darzacq, X. & Kiss, T. (1999) Mol Cell Biol 19, 6906-17.
299. Chen, Y., Sinha, K., Perumal, K., Gu, J. & Reddy, R. (1998) J Biol Chem 273, 35023-31.
300. Goodier, J. L., Ostertag, E. M., Engleka, K. A., Seleme, M. C. & Kazazian, H. H., Jr. (2004) Hum Mol Genet 13, 1041-8.
301. Piskareva, O. & Schmatchenko, V. (2006) FEBS Lett 580, 661-8.
302. Belancio, V. P., Hedges, D. J. & Deininger, P. (2006) Nucleic Acids Res 34, 1512-21.
303. Hiscox, J. A. (2002) Arch Virol 147, 1077-89.
304. Gabus, C., Ivanyi-Nagy, R., Depollier, J., Bucheton, A., Pelisson, A. & Darlix, J. L. (2006) Nucleic Acids Res 34, 5764-77.
305. Onafuwa-Nuga, A. A., King, S. R. & Telesnitsky, A. (2005) J Virol 79, 13528-37.
306. Giles, K. E., Caputi, M. & Beemon, K. L. (2004) Rna 10, 299-307.
307. Bohnert, H. U., Fudal, I., Dioh, W., Tharreau, D., Notteghem, J. L. & Lebrun, M. H. (2004) Plant Cell 16, 2499-513.
308. Dean, R. A., Talbot, N. J., Ebbole, D. J., Farman, M. L., Mitchell, T. K., Orbach, M. J., Thon, M., Kulkarni, R., Xu, J. R., Pan, H., Read, N. D., Lee, Y. H., Carbone, I., Brown, D., Oh, Y. Y., Donofrio, N., Jeong, J. S., Soanes, D. M., Djonovic, S., Kolomiets, E., Rehmeyer, C., Li, W., Harding, M., Kim, S., Lebrun, M. H., Bohnert, H., Coughlan, S., Butler, J., Calvo, S., Ma, L. J., Nicol, R., Purcell, S., Nusbaum, C., Galagan, J. E. & Birren, B. W. (2005) Nature 434, 980-6.
309. Kachroo, P., Leong, S. A. & Chattoo, B. B. (1995) Proc Natl Acad Sci U S A 92, 11125-9.
310. Daboussi, M. J. & Capy, P. (2003) Annu Rev Microbiol 57, 275-99.
311. Nishimura, M., Hayashi, N., Jwa, N. S., Lau, G. W., Hamer, J. E. & Hasebe, A. (2000) Mol Plant Microbe Interact 13, 892-4.
312. Buzdin, A., Gogvadze, E. & Lebrun, M. H. (2007) FEBS Lett 581, 2877-82.
313. Weiner, A. M., Deininger, P. L. & Efstratiadis, A. (1986) Annu Rev Biochem 55, 631-61.
314. Consortium, M. G. S. (2002) Nature 420, 520-62.
315. Buzdin, A. A. (2004) Cell Mol Life Sci 61, 2046-59.
316. Kidwell, M. G. & Lisch, D. (1997) Proc Natl Acad Sci USA 94, 7704-7711.
317. van de Lagemaat, L. N., Landry, J. R., Mager, D. L. & Medstrand, P. (2003) Trends Genet 19, 530-6.
318. Kovalskaya, E., Buzdin, A., Gogvadze, E., Vinogradova, T. & Sverdlov, E. (2006) Virology 346, 373-8.
319. Jasinska, A. & Krzyzosiak, W. J. (2004) FEBS Lett 567, 136-41.
320. Kazazian, H. H., Jr. (2004) Science 303, 1626-32.
321. Matz, M. V. & Lukyanov, S. A. (1998) Nucleic Acids Res 26, 5537-5543.
322. Velculescu, V. E., Vogelstein, B. & Kinzler, K. W. (2000) Trends Genet 16, 423-5.
323. Vinogradova, T. V., Leppik, L. P., Nikolaev, L. G., Akopov, S. B., Kleiman, A. M., Senyuta, N. B. & Sverdlov, E. D. (2001) Virology 290, 83-90.
324. Belshaw, R., Dawson, A. L., Woolven-Allen, J., Redding, J., Burt, A. & Tristem, M. (2005) J Virol 79, 12507-14.
325. Dewannieux, M., Blaise, S. & Heidmann, T. (2005) J Virol 79, 15573-7.
326. Mayer, J., Stuhr, T., Reus, K., Maldener, E., Kitova, M., Asmus, F. & Meese, E. (2005) J Mol Evol 61, 706-15.
327. Frank, O., Giehl, M., Zheng, C., Hehlmann, R., Leib-Mosch, C. & Seifarth, W. (2005) J Virol 79, 10890-901.
328. Hughes, J. F. & Coffin, J. M. (2004) Proc Natl Acad Sci U S A 101, 1668-72.
329. Weiner, A. M. (2002) Curr Opin Cell Biol 14, 343-50.
330. Esnault, C., Maestre, J. & Heidmann, T. (2000) Nat Genet 24, 363-7.
331. Lavie, L., Maldener, E., Brouha, B., Meese, E. U. & Mayer, J. (2004) Genome Res 14, 2253-60.
332. Speek, M. (2001) Mol Cell Biol 21, 1973-85.
333. Rakoff-Nahoum, S., Barbour, J. D., Lenz, J., Steinfeld, A. D. & Nixon, D. F. (2006) AIDS Res Hum Retroviruses 22, 52-6.
334. Herbst, H., Sauter, M., Kuhler-Obbarius, C., Loning, T. & Mueller -Lantzsch, N. (1998) Apmis 106, 216-220.
335. Thompson, J. D., Higgins, D. G. & Gibson, T. J. (1994) Nucleic Acids Res 22, 4673-4680.
336. Felsenstein, J. (1993) in distributed by the author. Department of Genetics, University of Washington, Seattle.
Благодарности
Автор выражает огромную признательность всем своим коллегам и учителям, так или иначе участвовавшим в данной работе, а в особенности: Е.Д.Свердлову за общее руководство и мудрые советы, И.А.Залунину и В.М.Степанову за первые уроки экспериментальной работы и эталонное отношение к научному процессу, Ю.Б.Лебедеву за методическую подготовку и чрезвычайно важные практические рекомендации, Е.В.Гогвадзе за вдумчивую и аккуратную экспериментальную работу, интересные и плодотворные идеи, Е.А.Ковальской-Александровой за титанический объём проделанной работы и желание идти до конца, преодолевая постоянно возникавшие сложности.