Материал: Рогожин В.В., Рогожина Т.В. Биохимия сельскохозяйственной продукции

Словарь терминов

Н

НЕЗАМЕНИМЫЕ АМИНОКИСЛОТЫ — аминокислоты, синтезирующиеся только в растениях и микроорганизмах и не образующиеся в организме животных и человека; к Н.а. относятся лизин, аргинин, гистидин, валин, лейцин, изолейцин, треонин, метионин, фенилаланин, триптофан.

НЕКОНКУРЕНТНАЯ АКТИВАЦИЯ — это тип активации, который проявляется в случае, если субстрат и активатор связываются независимо

вразличных участках активного центра фермента; при этом образуется тройной комплекс, в составе которого фермент-субстрат-активатор; связывание активатора ускоряет протекание каталитического процесса.

НЕКОНКУРЕНТНОЕ ИНГИБИРОВАНИЕ — этот тип ингибирования проявляется в том случае, когда ингибитор и субстрат связываются

вразных участках активного центра фермента; однако при связывании ингибитора образуется фермент-субстратный комплекс, превращение

вкотором субстрата становится невозможным.

НИКИ — однонитевидные разрывы в структуре ДНК. НИКОТИНАМИДАДЕНИНДИНУКЛЕОТИД (НАД+) — сложное

биологически активное соединение, функционально активной частью которого является никотинамид — амидированное производное витамина РР; НАД+ выполняет роль акцептора протонов и электронов в реакциях, катализируемых окислительно-восстановительными ферментами, восстанавливаясь до НАДН; в митохондриях при окислении одной молекулы НАДН, синтезируются три молекулы АТФ.

НИКОТИНАМИДАДЕНИНДИНУКЛЕОТИДФОСФАТ (НАДФ+) — фосфорилированная форма НАД+; участвует в катализируемых окисли- тельно-восстановительными ферментами реакциях в качестве кофермента; восстановленная форма НАДФН генерируется преимущественно ферментами пентозофосфатного цикла и используется в процессе синтеза жирных кислот — липогенезе.

НУКЛЕИНОВАЯ КИСЛОТА (РНК и ДНК) — биополимер, в состав которого входят пуриновые и пиримидиновые азотистые основания (аденин, гуанин, цитозин, урацил, тимин), а также моносахариды пентоз (рибоза или дезоксирибоза), связанные между собой остатками фосфорной кислоты.

НУКЛЕОЗИДЫ — соединения, в которых азотистые основания (пурины и пиримидины) связаны N-гликозидной связью с рибозой или дезоксирибозой (аденозин, гуанозин, тимидин, уридин, цитидин).

НУКЛЕОТИДЫ — фосфорные эфиры нуклеозидов, например: адениловая кислота (АМФ), гуаниловая кислота (ГМФ), цитидиловая кислота (ЦМФ), уридиловая кислота (УМФ), тимидиловая кислота (ТМФ); они также могут называться: аденозин-5’-фосфат, гуанозин-5’-фосфат, цити- дин-5’-фосфат, уридин-5’-фосфат, тимидин-5’-фосфат.

528

Словарь терминов

О

ОКИСЛИТЕЛЬНОЕ ФОСФОРИЛИРОВАНИЕ — процесс образования АТФ (процесс фосфорилирования АДФ), сопряженного с транспортом электронов по цепи переносчиков от НАДН или ФАДН к О2 (процесс окисления).

ОКИСЛИТЕЛЬНЫЙ СТРЕСС — стресс, возникающий у организмов под воздействием свободных радикалов кислорода; живые организмы активно потребляют кислород, который может вызывать окислительное повреждение тканей; в развитии окислительного стресса играют роль активные формы кислорода (АФК): О2–, Н2О2, НО , НОСl и др.; накопление АФК в клетках приводит к нарушению протекания процессов транскрипции и репликации, изменяет состав липидов мембран; супероксидные радикалы модифицируют белки, нарушают структуру ДНК, разрушают гормоны и другие функционально активные вещества.

ОКСИДОРЕДУКТАЗЫ — это класс ферментов, катализирующих реакции окисления и восстановления; О. подразделяются на 17 подклассов; субстраты О. являются донорами атомов водорода и электронов и поэтому ферменты этого класса называются дегидрогеназами или редуктазами (алкогольдегидрогеназа, лактатдегидрогеназа, малатдегидрогеназа, сукцинатдегидрогеназа, глиоксилатредуктаза, гидроксипируватредуктаза

идр.); коферментами О. могут быть НАД, НАДФ, ФАД, ФМН; к классу О. принадлежат и оксидазы, в реакциях которых участвует кислород (альдегидоксидаза, ксантиноксидаза, пируватоксидаза, оксалатоксидаза, оксидаза L-аминокислот, аминооксидаза и др.); представителями О. в молоке являются ферменты: пероксидаза, каталаза.

ОЛИГОСАХАРИДЫ — производные углеводов, содержащие от 2 до 10 остатков моносахаридов, соединенных О-гликозидной связью; основными О. являются лактоза, сахароза, мальтоза, целлобиоза, трегалоза.

ОПЕРАТОР — регуляторный участок ДНК, служащий местом связывания репрессоров — белков, контролирующих синтез преРНК.

ОПЕРОН (транскриптон) — это участок в структуре гена, являющийся элементарной единицей транскрипции, ограниченный промотором

итерминатором, участвующий в процессе биосинтеза молекулы преРНК у прокариот и эукариот; в структуре О. различают два участка: информативный и неинформативный.

П

ПЕНТОЗОФОСФАТНЫЙ ПУТЬ ОКИСЛЕНИЯ УГЛЕВОДОВ — процесс, в котором происходит ступенчатый окислительный распад гексоз

529

Словарь терминов

до пентоз и других сахаров с более короткой цепью; значение П.п.о.у. состоит в том, что он генерирует в цитоплазме НАДФН, необходимый для синтеза жирных кислот и стероидов; активность пентозофосфатного пути особенно высока в клетках печени, молочной железы, жировой ткани и коре надпочечников; П.п.о.у. поставляет пентозофосфаты для синтеза нуклеиновых кислот и нуклеотидов; суммарное уравнение реакций П.п.о.у. имеет следующий вид:

6Глюкозо-6-фосфат + 7Н2О + 12НАДФ+ →

→ 5Глюкозо-6-фосфат + 6СО2 + 12НАДФН + 12Н+ + Фн

В П.п.о.у. АТФ не синтезируется и не расходуется.

ПЕПТИДНАЯ СВЯЗЬ — ковалентная полярная связь, образованная между углеродом одной аминокислоты и азотом другой при соединении двух аминокислот между собой; П.с. относится к ковалентной полярной связи, обеспечивает стабильность первичной структуры белков (–NH–CO–).

ПЕРВИЧНАЯ СТРУКТУРА БЕЛКОВОЙ МОЛЕКУЛЫ — последовательное соединение α-аминокислот в полипептидную цепь, связанных между собой за счет пептидной связи согласно генетической информации, заложенной в ДНК.

ПЕРВИЧНАЯ СТРУКТУРА ДНК — структура, образованная за счет последовательного соединения нуклеотидов в полинуклеотидную цепь, связанных между собой сложноэфирной связью, образованной фосфатными остатками (3',5'-фосфодиэфирная связь) одного нуклеотида.

ПЕРЕКИСНОЕ ОКИСЛЕНИЕ ЛИПИДОВ — процесс окисления ненасыщенных жирных кислот продуктами свободнорадикального окисления.

ПЛАЗМАЛЕММА — клеточная мембрана.

ПЛАЗМИДЫ — добавочные маленькие кольцевые молекулы ДНК, присутствие которых необязательно для жизни клетки; П., содержащиеся в цитоплазме многих бактерий, способны автономно размножаться, стабильно наследоваться, т. е. сохраняться без специфической селекции во внехромосомном состоянии; кроме бактерий П. иногда содержат синезеленые водоросли, а из эукариотических организмов — дрожжи.

ПОЛИНДРОМЫ (перевертыши) — участки ДНК, содержащие последовательности нуклеотидов, повторяющиеся в обратном порядке.

ПОЛИСАХАРИДЫ — высокомолекулярные полимерные производные углеводов, образованные из последовательно соединенных моносахаридов, связанных между собой О-гликозидной связью; основными представителями П. являются: крахмал, гликоген, целлюлоза, клетчатка, хитин, агар-агар.

ПРАЙМАЗА — фермент, синтезирующий затравки (праймеры). ПРАЙМЕР — небольшой участок ДНК, используемый в качестве за-

травки при ее синтезе.

530

Словарь терминов

ПРИЗНАК — это совокупность показателей живого организма, проявляющих его индивидуальные свойства и особенности строения.

ПРОМОТОР — участок ДНК, служащий местом связывания ДНК-за- висимой РНК-полимеразы, участвующий в регуляции синтеза преРНК.

ПРОПЛАСТИДЫ — незрелые пластиды, содержащиеся в эмбриональных клетках растений; П. имеют оболочку, состоящую из двух цитоплазматических мембран и полость, заполненную бесструктурным матриксом; внутренняя мембранная структура П. развита очень слабо, представлена обычно одиночными цистернами или трубочками и пузырьками, расположенными без определенной ориентации; П. могут превращаться в лейкопласты, хлоропласты и хромопласты.

ПРОСТЕТИЧЕСКАЯ ГРУППА — низкомолекулярное соединение небелковой природы, прочно связанное с апобелком; выполняет активную роль в ферментативном катализе: при отсутствии ее фермент неактивен; к П.г. относятся: гем в пероксидазе и каталазе, изоаллоксазиновое кольцо в флавиновых ферментах и др.

ПРОТЕОЛИЗ — процесс гидролитического разрушения нативной структуры белков; большинство внутриклеточных белков заканчивают существование в результате протеолитического гидролиза, превращаются в небольшие пептиды и свободные аминокислоты, которые утилизируются в синтезе новых белков.

ПРОЦЕССИНГ (посттранскрипционная модификация) — процесс формирования зрелых молекул РНК (тРНК, мРНК, рРНК) из неактивного предшественника (преРНК) в эукариотической клетке; в результате П. происходят следующие действия: отрезание «лишних» концевых последовательностей; расщепление длинных первичных транскриптов, вырезание их них участков, транскрибированных с интронов; добавление нуклеозидов к 3′-концу транскрипта; добавление нуклеотидов к 5′-концу транскрипта; модификация оснований в транскрипте; при этом конечным этапом П. является метилирование мРНК, в результате которого на каждые 400 остатков аденинов приходится один остаток 6-метиладенина.

ПЦР (полимеразная цепная реакция) — это метод, который позволяет найти в исследуемом клиническом материале небольшой участок генетической информации любого организма среди огромного количества других участков и многократно размножить его; метод ПЦР основан на принципе естественной репликации ДНК, включающем расплетение двойной спирали ДНК, расхождение нитей ДНК и комплиментарное дополнение обеих.

Р

РЕКОМБИНАНТНАЯ ДНК — это измененные химерные молекулы ДНК, составленные из фрагментов разного происхождения или в струк-

531

Словарь терминов

туру нативной ДНК введены чужеродные последовательности или новые гены.

РЕКОМБИНАНТНЫЙ БЕЛОК — это белок, полученный искусственным путем, в состав полипептидной цепи которого введены чужеродные аминокислоты.

РЕПАРАЦИЯ — процесс восстановления поврежденных участков ДНК. РЕПЛИКАЦИЯ — процесс синтеза ДНК путем ее удвоения; синтез одной дочерней цепи происходит в направлении 5′→3′, осуществляется непрерывно, в то время как синтез второй цепи в направлении 3′→5′происходит прерывисто путем соединения коротких фрагментов, называемых фрагментами Оказаки, синтезируемых в противоположном направлении. РЕПРЕССИЯ ГЕНОВ — ингибирование процесса транскрипции (или трансляции) белком-репрессором за счет его специфического свя-

зывания с регуляторным участком в структуре ДНК или РНК.

С

САЙТ — короткая последовательность нуклеотидов в составе ДНК, РНК или аминокислот в белке.

САТЕЛЛИТНАЯ ДНК (от лат. satellitis — спутник, сопровождающий) ДНК эукариот, содержащая многократно повторяющиеся последовательности нуклеотидов.

СВИВЕЛАЗЫ — ферменты, устраняющие суперспирализацию ДНК, разрывая одну из цепей ДНК, благодаря чему делается возможным раскрывание этой цепи с последующим замыканием разрыва.

СВОБОДНЫЙ РАДИКАЛ — атом или молекула, содержащая неспаренный электрон; С.р. обладают высокой реакционной способностью, ядовиты для живых организмов, могут вызывать мутации; представителями С.р. являются: О2– — супероксидрадикал; ОН — гидроксид радикал, НО2 — гидропероксидный радикал и др.

СИНЕРГИЧЕСКАЯ АКТИВАЦИЯ — это тип активации, который наблюдается в том случае, если связывание активатора в активном центре фермента увеличивает сродство фермента к субстрату, проявляемое в понижении величины константы связывания (Ks или Km); при этом значение kcat не меняется, а график в координатах Лайнуивера-Берка имеет вид семейства прямых с точкой пересечения на оси ординат.

СМЕШАННЫЕ ТИПЫ ИНГИБИРОВАНИЯ — проявляются в случае взаимного влияния субстрата и ингибитора как при их связывании, так и при превращении субстрата; при этом графики в координатах Лайну- ивера–Берка принимают вид семейства прямых, с общей точкой пере-

532